MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Hydrogenobacter thermophilus TK-6

Total Repeats: 1868

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013799	CAA	2	6	10	15	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_013799	TGA	2	6	18	23	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013799	AGA	3	9	84	92	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013799	AGG	2	6	1307	1312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013799	G	6	6	3582	3587	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013799	GCG	2	6	3618	3623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_013799	TA	3	6	3689	3694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013799	ATAA	2	8	3695	3702	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013799	CTCC	2	8	3773	3780	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
10	NC_013799	TCC	2	6	8548	8553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_013799	TA	3	6	11899	11904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013799	AG	3	6	11946	11951	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013799	GCAG	2	8	11954	11961	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_013799	GCTC	2	8	12005	12012	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_013799	CTAA	2	8	12020	12027	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_013799	CCA	2	6	12253	12258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_013799	TA	3	6	23879	23884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013799	TCA	2	6	23931	23936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_013799	TAT	2	6	23946	23951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013799	GCC	2	6	23986	23991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_013799	GTA	2	6	27473	27478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013799	AGG	2	6	27482	27487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013799	TGGA	2	8	27506	27513	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013799	ATATA	2	10	35831	35840	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013799	TA	3	6	38893	38898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013799	ATT	2	6	39568	39573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013799	CCT	2	6	50113	50118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_013799	AGG	2	6	50124	50129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013799	ACCC	2	8	50142	50149	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
30	NC_013799	AGG	2	6	50161	50166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013799	GGTG	2	8	50190	50197	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013799	CT	3	6	50274	50279	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_013799	ACC	2	6	50280	50285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_013799	GGCAG	2	10	50286	50295	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
35	NC_013799	TAC	2	6	54404	54409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_013799	TA	3	6	57495	57500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013799	CAA	2	6	57519	57524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_013799	TCC	2	6	57763	57768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_013799	AATATA	2	12	57776	57787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013799	TTA	2	6	57788	57793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013799	TA	3	6	57792	57797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013799	TAAT	2	8	59391	59398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013799	CCT	2	6	60647	60652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_013799	TA	3	6	60681	60686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013799	AGGTT	2	10	60731	60740	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013799	CCT	2	6	63664	63669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_013799	CCT	2	6	64203	64208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_013799	CA	3	6	64265	64270	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_013799	AGG	2	6	64592	64597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013799	A	6	6	64599	64604	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013799	AAT	2	6	64634	64639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013799	TAT	2	6	69902	69907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013799	AT	4	8	74371	74378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013799	A	6	6	74388	74393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013799	AT	3	6	75811	75816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013799	AGG	2	6	75847	75852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013799	AT	3	6	78477	78482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013799	TATAT	2	10	79373	79382	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013799	CTTC	2	8	79387	79394	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_013799	C	6	6	79394	79399	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
61	NC_013799	TAA	2	6	79430	79435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013799	TTTAA	2	10	79467	79476	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013799	T	10	10	79514	79523	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013799	ATG	2	6	79547	79552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013799	AGG	2	6	79624	79629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013799	CCT	2	6	84011	84016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_013799	CCT	2	6	84456	84461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_013799	ATA	2	6	84481	84486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013799	TCT	2	6	84514	84519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_013799	TC	3	6	85792	85797	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_013799	AT	3	6	92643	92648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013799	TA	3	6	96426	96431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013799	TA	3	6	96434	96439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013799	AGG	2	6	98176	98181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013799	TAT	2	6	103226	103231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013799	CTTA	2	8	103242	103249	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_013799	TTAA	2	8	103284	103291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013799	TTG	2	6	103357	103362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013799	A	6	6	103374	103379	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013799	C	6	6	113593	113598	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
81	NC_013799	ACC	2	6	115322	115327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_013799	AGA	2	6	120268	120273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013799	AGG	2	6	120274	120279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013799	TGT	2	6	125351	125356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013799	TAT	2	6	125357	125362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013799	TTA	2	6	125406	125411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013799	A	6	6	127390	127395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013799	AAG	2	6	127409	127414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013799	GGA	2	6	127975	127980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013799	TCC	2	6	135572	135577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_013799	TACAT	2	10	135580	135589	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_013799	TAT	2	6	135604	135609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013799	AGG	2	6	135674	135679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013799	TCC	2	6	140759	140764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_013799	A	6	6	140781	140786	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013799	TTA	2	6	140796	140801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013799	TTA	2	6	142905	142910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013799	TA	3	6	142909	142914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013799	TTA	2	6	151107	151112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013799	CCT	2	6	157809	157814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_013799	AAAT	2	8	157820	157827	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013799	ATTATA	2	12	157839	157850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013799	TACT	2	8	162269	162276	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_013799	TAAA	2	8	162299	162306	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013799	CGCA	2	8	162360	162367	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_013799	ATTA	2	8	162374	162381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013799	GTAA	2	8	162382	162389	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013799	AGG	2	6	162399	162404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013799	CCT	2	6	170355	170360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_013799	CCT	2	6	170828	170833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_013799	T	7	7	170874	170880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013799	ACCC	2	8	170911	170918	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
113	NC_013799	TCT	2	6	170948	170953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_013799	AGG	2	6	173997	174002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013799	TC	3	6	174226	174231	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_013799	ATT	2	6	174916	174921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013799	T	6	6	181031	181036	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013799	GGA	2	6	181926	181931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013799	CCT	2	6	194121	194126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_013799	ATG	2	6	194189	194194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013799	TTG	2	6	194196	194201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013799	AT	3	6	194205	194210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013799	TGT	2	6	194215	194220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013799	AGG	3	9	194223	194231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013799	AC	3	6	197015	197020	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_013799	AGG	2	6	197101	197106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013799	TAT	2	6	199505	199510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013799	TACT	2	8	201390	201397	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_013799	TGC	2	6	201769	201774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_013799	TAA	2	6	201801	201806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013799	ATATT	2	10	201809	201818	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013799	CCT	2	6	203194	203199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_013799	AGG	2	6	203283	203288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013799	CAT	2	6	210174	210179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_013799	CGTTTT	2	12	210194	210205	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_013799	ATG	2	6	210207	210212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013799	ATA	2	6	210219	210224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013799	TAA	2	6	210254	210259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013799	CCT	2	6	215490	215495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_013799	ATTT	2	8	215623	215630	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013799	GTG	2	6	216891	216896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013799	AGG	2	6	216897	216902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013799	TTA	2	6	216935	216940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013799	TAT	2	6	216956	216961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013799	A	6	6	216975	216980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013799	CCT	2	6	219081	219086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_013799	CCT	2	6	219386	219391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_013799	AAG	2	6	219429	219434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_013799	GAT	2	6	219439	219444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_013799	ATT	3	9	219457	219465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_013799	AAG	2	6	219504	219509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_013799	ACC	2	6	219550	219555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
153	NC_013799	ATTA	2	8	223174	223181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_013799	TCT	2	6	223887	223892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_013799	ATTA	2	8	224889	224896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_013799	T	6	6	226524	226529	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_013799	A	6	6	229310	229315	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_013799	A	6	6	229344	229349	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_013799	A	7	7	229370	229376	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_013799	GT	3	6	229379	229384	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
161	NC_013799	T	6	6	229415	229420	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_013799	AG	3	6	229552	229557	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
163	NC_013799	TAT	2	6	234596	234601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_013799	TCAC	2	8	234603	234610	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
165	NC_013799	TAT	2	6	236271	236276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_013799	TTAC	2	8	236308	236315	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
167	NC_013799	ATTCAC	2	12	238192	238203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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169	NC_013799	AGG	2	6	238259	238264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
170	NC_013799	AGG	2	6	240365	240370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
171	NC_013799	GAC	2	6	242567	242572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
172	NC_013799	CGTGC	2	10	242582	242591	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
173	NC_013799	ATC	2	6	242604	242609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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175	NC_013799	CTG	2	6	242776	242781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
176	NC_013799	GA	3	6	242901	242906	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
177	NC_013799	GGAC	2	8	242953	242960	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
178	NC_013799	CGG	2	6	242983	242988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
179	NC_013799	G	6	6	243087	243092	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
180	NC_013799	TGG	2	6	243211	243216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
181	NC_013799	GCG	2	6	243222	243227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
182	NC_013799	AGG	2	6	243925	243930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
183	NC_013799	ACA	2	6	243981	243986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
184	NC_013799	CGG	2	6	244124	244129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
185	NC_013799	AGG	2	6	244177	244182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
186	NC_013799	GCC	2	6	244185	244190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
187	NC_013799	CTCGG	2	10	244233	244242	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
188	NC_013799	GGT	2	6	244264	244269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
189	NC_013799	TCCC	2	8	244288	244295	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
190	NC_013799	GGA	2	6	244296	244301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
191	NC_013799	CTC	2	6	244440	244445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
192	NC_013799	CGGC	2	8	244532	244539	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
193	NC_013799	C	6	6	244722	244727	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
194	NC_013799	GAG	2	6	244766	244771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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197	NC_013799	TGCC	2	8	244923	244930	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
198	NC_013799	CTA	2	6	244939	244944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
199	NC_013799	ACC	2	6	244951	244956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
200	NC_013799	CCT	2	6	244980	244985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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269	NC_013799	ATT	2	6	269260	269265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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272	NC_013799	TCC	2	6	269334	269339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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275	NC_013799	GT	3	6	277676	277681	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
276	NC_013799	TAA	2	6	282065	282070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
277	NC_013799	GGA	2	6	282103	282108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
278	NC_013799	A	7	7	282117	282123	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
279	NC_013799	ATA	2	6	282160	282165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
280	NC_013799	AG	4	8	282451	282458	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
281	NC_013799	GGAA	2	8	282472	282479	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
282	NC_013799	TGGG	2	8	282506	282513	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
283	NC_013799	TTGA	2	8	282525	282532	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
284	NC_013799	CTC	2	6	284944	284949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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286	NC_013799	TTA	2	6	285009	285014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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